Zasady funkcjonowania Instytutu Strat Wojennych im. Jana Karskiego określa Statut Instytutu Strat Wojennych im. Jana Karskiego, stanowiący Załącznik do Zarządzenia nr 321 Prezesa Rady Ministrów z dnia 2 grudnia 2021 r. w sprawie utworzenia Instytutu Strat Wojennych im. Jana Karskiego.